Đại dịch COVID-19 được xác nhận đã lan sang châu Phi vào ngày 14 tháng 2 năm 2020. Ca bệnh được xác nhận đầu tiên là ở Ai Cập,[1][2] và trường hợp được xác nhận đầu tiên ở châu Phi Hạ Sahara là ở Nigeria.[3] Hầu hết các ca bệnh nhập khẩu được xác định đã đến từ châu Âu và Hoa Kỳ chứ không phải từ Trung Quốc.[4] Hầu hết các ca bệnh được báo cáo là từ bốn quốc gia: Nam Phi, Morocco, Ai Cập và Algeria, nhưng người ta tin rằng có báo cáo dưới mức phổ biến ở các quốc gia châu Phi khác có hệ thống chăm sóc y tế kém phát triển.[5]Các chuyên gia đã lo lắng về việc COVID-19 lan sang châu Phi, bởi vì các hệ thống chăm sóc sức khỏe trên lục địa này không đầy đủ, có vấn đề như thiếu thiết bị, thiếu kinh phí, đào tạo nhân viên y tế không đủ và truyền tải dữ liệu không hiệu quả. Người ta sợ rằng đại dịch có thể khó kiểm soát ở châu Phi và có thể gây ra những vấn đề kinh tế lớn nếu nó lan rộng.[4][6] Tính đến ngày 18 tháng 4 năm 2020, nguồn cung máy thở ở hầu hết châu Phi đều thấp: 41 quốc gia chỉ có 2.000 máy thở, và 10 quốc gia không có máy thở. Ngay cả các nguồn cung cấp cơ bản như xà phòng và nước cũng có thể bị thiếu hụt ở các phần của lục địa này.[7]Matshidiso Moeti thuộc Tổ chức Y tế Thế giới cho biết, việc rửa tay và xa vật lý có thể là thách thức ở một số nơi ở Châu Phi. Việc phong tỏa là không thể, và những thách thức có thể trở nên trầm trọng hơn do sự phổ biến của các bệnh như sốt rét, HIV, bệnh lao và bệnh tả.[6] Các cố vấn nói rằng một chiến lược dựa trên thử nghiệm có thể cho phép các nước châu Phi giảm thiểu việc phong tỏa mà sẽ gây khó khăn rất lớn cho những người phụ thuộc vào thu nhập kiếm được hàng ngày để có thể nuôi sống bản thân và gia đình. Ngay cả trong kịch bản tốt nhất, Liên Hợp Quốc cho biết 74 triệu bộ dụng cụ thử nghiệm và 30.000 máy thở sẽ cần thiết cho 1,3 tỷ người của lục địa này vào năm 2020.[8] Tổ chức Y tế Thế giới đã giúp nhiều quốc gia trên lục địa thành lập các phòng thí nghiệm để xét nghiệm COVID-19. Matshidiso Moeti của WHO cho biết: "Chúng tôi cần kiểm tra, theo dõi, phân lập và điều trị.[9] Nhiều biện pháp phòng ngừa đã được thực hiện ở các quốc gia khác nhau ở Châu Phi, bao gồm hạn chế đi lại, hủy chuyến bay, hủy bỏ sự kiện, đóng cửa trường học và đóng cửa biên giới.[10] Các chuyên gia nói rằng kinh nghiệm chiến đấu với Ebola đã giúp một số quốc gia tại đây chuẩn bị cho COVID-19.[11]Vào ngày 13 tháng 5 năm 2020, Lesoto trở thành quốc gia có chủ quyền châu Phi cuối cùng báo cáo có ca nhiễm COVID-19;[12][13] không có trường hợp nào được báo cáo ở Lãnh thổ Ấn Độ Dương thuộc Anh, Lãnh thổ phía Nam thuộc Pháp và Saint Helena.