Manga Elfen Lied, sáng tác bởi Lynn Okamoto, được ra mắt từ giữa tháng 6 năm 2002 đến tháng 8 năm 2005 tại Nhật Bản trên tạp chí hàng tuần Yuong Jump; vài tháng sau khi phát hành, nhà xuất bản Shūeisha đã tập hợp các chương lại thành các tập tankōbon, cuối cùng 12 tập truyện với tổng cộng 107 chương đã được xuất bản tại Nhật và nhiều nước khác.[1]

Theo tác giả, Elfen Lied ban đầu chỉ có kế hoạch sáng tác 2 tập, và nhờ nhận được sự ủng hộ nhiệt liệt từ đọc giả đã tạo nguồn động lực thúc đẩy ông nâng độ dài câu chuyện để đáp ứng mong đợi của họ.[50]

Suốt 3 năm phát hành manga đã cho thấy sự tiến bộ rõ rệt trong phong cách vẽ của Lynn Okamoto. Nói theo cách của mình, ông nhận xét rằng tập truyện đầu tiên được ra mắt với một «nét vẽ rất vụng về và trẻ con», ông nhận ra sự thiếu sót đó và quyết định nâng cao kĩ thuật vẽ của mình hơn, mặc dù «đã sử dụng rất nhiều cách để thu hút người xem».[51]

Năm 2008, tuy chưa có giấy phép cho các bản dịch manga chính thức bằng tiếng Anh, nhưng các nhà xuất bản lớn như Tokyopop, Ever Glory Publishing Co., Ltd. và Grupo Editorial Vid đã mua được bản quyền và phát hành truyện tại các nước tương ứng của họ là Đức, Trung Quốc và Tây Ban Nha[1]

Bảng dưới đây liệt kê các tập truyện cùng ngày phát hành của chúng tại Nhật Bản:[52][53]

Ngoại truyện

Trong số các tập manga còn kèm theo sáu chương truyện đặc biệt cũng do Okamoto sáng tác. Bốn câu chuyện đầu tiên được xem như là one-shots (truyện một chương) và không liên quan gì đến diclonius. Câu chuyện thứ năm nói về Nozomi (vốn là một nhân vật trong cốt truyện chính), cung cấp thêm một số thông tin cơ bản cho nhân vật này. Câu chuyện cuối liên quan đến các nhân vật trong Elfen Lied, được xem là quà tặng cho người hâm mộ và không ảnh hưởng gì đến cốt truyện chính. Sau đây là đoạn mô tả kĩ hơn nội dung các ngoại truyện:

• MOL, phát hành kèm với tập đầu tiên.[54][55] Nói về một người đàn ông trẻ tuổi lập dị sống ở một thị trấn nhỏ, nơi đặt phòng nghiên cứu của anh. Cuộc sống của anh thay đổi khi tìm thấy trong nhà mình một phụ nữ trẻ tuổi, kích thước cỡ con búp bê trốn thoát khỏi phòng nghiên cứu, nơi anh đang thực hiện một số thí nghiệm khủng khiếp.
• Digitópolis (デジトポリス, Dejitoporisu?), phát hành kèm với tập thứ hai.[56][57] Nói về một thành viên táo bạo của một đơn vị đặc nhiệm chuyên về tháo gỡ thuốc nổ. Giải thích lý do chọn công việc nguy hiểm đó, anh kể rằng do cha mẹ anh đã mất trong một vụ tai nạn đánh bom xe được cài mìn từ trước.
• Memoria (メモリア, Memoria?), phát hành kèm với tập thứ ba[58][59] Nói về một thanh niên trẻ mua một con búp bê kì lạ tặng cho cha mẹ của một cô gái để họ đón nhận anh làm con rể sau 12 năm mắc bệnh nằm liệt trên giường. Sau khi đem con búp bê vô tri ấy về nhà được vài ngày, họ phát hiện ra trong con vật ấy có một sức sống khác thường, nó thể hiện ước mong của cô gái và chàng trai được gặp lại nhau. Trên thực tế họ đạ gặp và đem lòng yêu thương nhau suốt thời thơ ấu.
• Elfen Lied (エルフェンリート, Elfen Lied?), phát hành kèm với tập thứ năm.[60][61] Nói về một chàng trai và một cô gái nghệ sĩ piano trong Cuộc thi piano quốc tế Frédéric Chopin; sau cuộc thi, cô gái bỗng quyết định trở thành nghệ sĩ violon bởi vì cô không thể vượt qua được tài năng của chàng trai, và họ sau này trở thành bộ đôi chơi piano-violon giỏi nhất thế giới.
• Another happy future (もうひとつのしあわせな未来, Another happy future?), phát hành kèm với tập thứ tám.[62][63] Câu chuyện này có liên quan đến một nhân vật trong cốt truyện chính. Nó giải thích niềm đam mê ca hát của Nozomi và cô từ chối học ở các trường đại học khác theo lệnh của cha cô như thế nào. Đó cũng là lý do cô chuyển đến quán trọ sống chung với mọi người ở đấy, để học tập và thực hành chờ đến ngày thi tuyển sinh vào một trường âm nhạc.
• Does sake make one drink or make one drunk? (酒は呑むほう呑まれるほう?, Does sake make one drink or make one drunk??), phát hành kèm với tập thứ tám.[63][64] Truyện này có sự xuất hiện của các nhân vật chính trong Elfen Lied nhưng không ảnh hưởng đến cốt truyện chính. Trong đó, mọi người ở quán trọ uống quá nhiều rượu sake nên say và ngủ cả. Riêng Yuka và Nyu không kiềm chế được đã vào phòng của Kouta và lả lơi với anh. Cuộc vui bị gián đoạn khi bất ngờ Lucy quay về nhân cách cũ và nổi giận. Rất may là không có chuyện đáng tiếc xảy ra và câu chuyện kết thúc trong một hoàn cách khó xử.