Chymotrypsin (EC 3.4.21.1, chymotrypsins A và B, alpha-chymar ophth, avazyme, chymar, chymotest, enzeon, quimar, quimotrase, alpha-chymar, alpha-chymotrypsin A, alpha-chymotrypsin) là một enzyme tiêu hóa thành phần của dịch tụy đổ vào trong tá tràng, nơi nó thực hiện phân giải protein.[1] Chymotrypsin ưu tiên cắt các liên kết peptide amide trong đó chuỗi bên của đầu nối axit amin C đến liên kết amit P1, là một axit amin kỵ nước có khối lượng phân tử lớn (tyrosine, tryptophan và phenylalanine). Các axit amin này chứa một vòng thơm trong chuỗi bên của chúng phù hợp với phần kỵ nước (vị trí S1) của enzyme. Nó được kích hoạt với sự có mặt của trypsin.[2][3] Chymotrypsin cũng thủy phân các liên kết amide khác trong peptide với tốc độ chậm hơn, đặc biệt là những liên kết có chứa leucine và methionine ở vị trí P1.