Rc-o319 là một chủng
virus corona liên quan đến hội chứng hô hấp cấp tính nặng có nguồn gốc từ dơi được thu thập ở
dơi móng ngựa Nhỏ Nhật Bản (Rhinolophus cornutus) ở
Iwate,
Nhật Bản.
[1] Chủng này có mã gen tương đồng 81% với
SARS-CoV-2 và là nhánh chủng sớm nhất của virus corona liên quan đến SARS-CoV-2.panCây phát sinh loài dựa trên trình tự toàn bộ bộ gen của SARS-CoV-2 và các virus corona liên quan:
[2][3][4]Rc-o319, 81% tương đồng với SARS-COV-2,
Rhinolophus cornutus,
Iwate,
Nhật Bản[1]SL-ZXC21, 88% tương đồng với SARS-COV-2,
Rhinolophus pusillus,
Chu Sơn,
Chiết Giang[5]SL-ZC45, 88% tương đồng với SARS-COV-2,
Rhinolophus pusillus,
Chu Sơn,
Chiết Giang[5]SARSr-COV-GX
tê tê, 89% tương đồng với SARS-COV-2,
Manis javanica, từ Đông Nam Á
[6]SARSr-COV-GD
tê tê, 91% tương đồng với SARS-COV-2,
Manis javanica, từ Đông Nam Á
[7]RshSTT182, 92.6% tương đồng với SARS-COV-2,
Rhinolophus shameli,
Steung Treng,
Campuchia[4]RshSTT200, 92.6% tương đồng với SARS-COV-2,
Rhinolophus shameli,
Steung Treng,
Campuchia[4]RacCS203, 91.5% tương đồng với SARS-COV-2,
Rhinolophus acuminatus,
Chachoengsao,
Thái Lan[3]RmYN02, 93.3% tương đồng với SARS-COV-2,
Rhinolophus malayanus Mãnh Lạp,
Vân Nam[8]RpYN06, 94.4% tương đồng với SARS-COV-2,
Rhinolophus pusillus,
Châu tự trị dân tộc Thái Tây Song Bản Nạp,
Vân Nam[2]RaTG13, 96.1% tương đồng với SARS-COV-2,
Rhinolophus affinis,
Huyện tự trị dân tộc Cáp Nê Mặc Giang,
Vân NamSARS-CoV-2SARS-CoV-1, 79% tương đồng với SARS-COV-2