Giải bóng đá U21 quốc gia 2016 có tên gọi đầy đủ là Giải bóng đá vô địch U21 Quốc gia Báo Thanh Niên lần thứ 20 năm 2016 - Cúp Clear Men là mùa giải lần thứ 20 của giải bóng đá U21 Quốc gia do VFF tổ chức cùng với Công ty cổ phần tập đoàn truyền thông Thanh Niên tài trợ. Giải đấu này với sự góp mặt của 18 đội bóng diễn ra theo hai giai đoạn, vòng loại sẽ khởi tranh từ ngày 2/10/2016 và kết thúc vào ngày 13/10/2016. Vòng chung kết diễn ra từ 23/10 đến ngày 2/11/2016 trên sân vận động Cẩm Phả tại Quảng Ninh.[1]