Giải bóng đá Cúp Quốc gia 1996 là giải đấu Cúp được tổ chức lần thứ 5 với sự tham gia của các câu lạc bộ hoặc đội bóng tại Việt Nam. Năm 1996, VFF tổ chức Giải bóng đá Cúp Quốc gia lần thứ 5 các đội tham dự chia theo 3 khu vực chọn lấy 8 đội vào vòng chung kết tổ chức tại Thành phố Hồ Chí Minh. Giải khởi tranh từ tháng 8 năm 1996 và kết thúc vào ngày 5 tháng 12 năm 1996. Hải Quan đăng quang chức vô địch sau khi đánh bại Cảng Sài Gòn với kết quả hòa 0-0 và thắng sau loạt sút luân lưu 11m với tỷ số 6-5 tại Sân vận động Thống Nhất, Thành phố Hồ Chí Minh [1][2].