O1c2c(OC1)cc5c(c2)c4cc3ccc(OC)c(OC)c3c[n+]4CC5Berberine là một muối ammonium bậc bốn muối từ nhóm protoberberine của các alkaloid benzylisoquinoline được tìm thấy trong các loài thực vật như Berberis (ví dụ Berberis vulgaris, Berberis aristata, Mahonia aquifolium, Hydrastis canadensis, Xanthorhiza simplicissima, Phellodendron amurense[2], Coptis chinensis, Tinospora cordifolia, Argemone mexicana và Eschscholzia californica – Californian poppy). Berberine thường được tìm thấy trong rễ, thân rễ, thân và vỏ cây.[cần dẫn nguồn]Do màu vàng mạnh mẽ của berberine, các loài Berberis đã được sử dụng để nhuộm len, da và gỗ. Len vẫn được nhuộm bằng berberine ngày nay ở miền bắc Ấn Độ.[3] Dưới tia cực tím, berberine cho thấy màu vàng mạnh huỳnh quang,[4] vì vậy nó rất hữu ích trong mô học cho nhuộm heparin trong tế bào mast.[5] Là thuốc nhuộm tự nhiên, berberine có chỉ số màu là 75160.