Đoạn chính thứ hai của S-Bahn München là một dự án mở rộng S-Bahn München được tranh luận sôi nổi kể từ thập niên 1990. Nó cung cấp thêm một đoạn đường xe điện ngầm đi qua thành phố chạy song song với đoạn chính đầu tiên được khai mạc năm 1971. Đoạn đường chính được hoạch định cho khoảng 250 ngàn hành khách mỗi ngày vào lúc tổ chức Thế vận hội 1972, nhưng hiện nay (2018) trong những ngày làm việc khoảng 840 ngàn hành khách sử dụng đoạn này.[2]Dự án kéo dài, giữa các trạm Leuchtenbergring và Laim, trên một đoạn có chiều dài 11 km, trong đó khoảng 7 km chạy trong đường hầm dưới đất có độ sâu có thể đến khoảng 48 m. Các trạm dưới đất Hauptbahnhof, Marienhof và Ostbahnhof được xây mới, các trạm trên mặt đất Laim và Leuchtenbergring được xây dựng lại.[3] Các trạm Karlsplatz / Stachus, Isartor và Rosenheimerplatz của đoạn chính đầu tiên không có trạm tương đương. Mục tiêu của dự án được cho biết là để tăng cường năng lực vận tải giữa hai trạm Laim và Leuchtenbergring và cải thiện cho xe chạy được đúng giờ hơn trong suốt mạng S-Bahn. Nhưng những lời chỉ trích của kế hoạch nghi ngờ rằng điều này có thể đạt được theo cách này.Vào ngày 25 tháng 10 năm 2016, thỏa hiệp tài chính giữa Nhà nước, Thành phố, Bang và hãng Đường sắt được ký kết. Theo đó tuyến đường sẽ đi vào hoạt động năm 2026. Tổng chi phí gần 3,84 tỷ euro (bao gồm cả rủi ro có thể xảy ra), gần 3,2 tỷ euro (chưa trừ hao rủi ro) [4]Theo kế hoạch ngày 5 tháng 4 năm 2017 một lễ hội ăn mừng sẽ được tổ chức biểu tượng cho công trình xây dựng bắt đầu.[5]