Vịnh San Francisco là một vùng cửa sông nông tại tiểu bang California, Hoa Kỳ. Đây là cửa biển mà thông qua nó khoảng 40% lượng nước của tiểu bang California từ các con sông: Sacramento và San Joaquin từ các vùng núi Sierra Nevada đổ ra Thái Bình Dương. Về mặt kỹ thuật thì cả hai con sông này đổ vào vịnh Suisun, mà vịnh này lại đổ vào eo biển Carquinez để gặp sông Napa tại cửa vào vịnh San Pablo, một vịnh nối phía nam của nó vào vịnh San Francisco, dù toàn bộ nhóm các vịnh liên kế nhau này được gọi chung là "vịnh San Francisco."Vịnh San Francisco được bao bọc bởi vùng tiếp giáp nó gọi là Khu vực vịnh San Francisco, một khu vực có các thành phố lớn như San Francisco, Oakland, và San Jose.