Football Alliance 1889–90 là mùa giải đầu tiên của Football Alliance, một giải bóng đá được tổ chức tại Anh dựa theo The Football League, giải đấu bắt đầu từ mùa 1888–89. Một đề xuất mở rộng Football League lên thành 24 đội bị bác bỏ, vì thế một giải đấu mới được tạo ra. Mười hai đội bóng được công nhận là thành viên,[1] bằng với số đội của Football League, và cũng tương tự về địa lý, kéo dài từ Trung du tới Tây Bắc, hơn thế còn kéo về phía đông với Sheffield, Grimsby và Sunderland.[2]Hai điểm cho một trận thắng, một cho một trận hòa, mỗi đội thi đấu với đội khác một trận sân khách, một trận sân nhà. The Wednesday là nhà vô địch đầu tiên; sau khi có chuỗi 8 trận thắng bắt đầu từ tháng Mười một, họ lên ngôi đầu vào tháng 12 và tiếp tục đến hết phần còn lại của mùa giải. Long Eaton Rangers đội xếp cuối trong 12 đội đã rời bỏ liên minh để trở về Midland Football League.[2]