Đại học James Cook Singapore thành lập năm 1961 với tên gọi University of Townsville như là thành viên của trường Đại học bang Queensland. Năm 1970, trường được chính thức thành lập với tên Đại học James Cook mang tên nhà thám hiểm người Anh James Cook tại Townsville, bang Qeensland, Úc. Năm 1987, trụ sở tại Cairns được thành lập và năm 2003 trụ sở tại Singapore được thành lập. Đến năm 2006, trụ sở tại thành phố Brisibane, thủ phủ bang Queensland được thành lập và phục vụ cho du học sinh quốc tế với chi phí học tập hợp lý và hình thức học tập được cải tiến nhất.Số lượng sinh viên của trường tăng nhanh từ con số 500 vào năm 2003 đến con số 2000 vào năm 2010. JCU Singapore được xem là môi trường đa văn hóa với các thành phần sinh viên Singapore và quốc tế đến từ Trung Quốc, Ấn Độ, Đông Nam Á, châu Âu và Hoa Kỳ.