Đại dịch cúm 2009 tại Malaysia là một phần của đại dịch cúm lớn hơn liên quan đến một chủng loại virus mới là cúm A H1N1. Tính đến ngày 11 tháng 8 năm 2009, Malaysia đã có 2,253 trường hợp, với những ca bắt nguồn từ một số quốc gia bị ảnh hưởng, bao gồm cả Úc và Hoa Kỳ từ ngày 15 tháng 5 năm 2009 trở đi, và lần đầu tiên được xác định lây nhiễm tại địa phương vào ngày 17 tháng 6 năm 2009. Từ ngày 12 tháng 8, Bộ Y tế Malaysia cho biết họ đã chính thức ngừng cập nhật tổng số ca mắc H1N1 tại Malaysia theo hướng dẫn của Tổ chức Y tế Thế giới. Tính đến ngày 21 tháng 8 năm 2009, số ca mắc bệnh không chính thức trên truyền thông là 5,876 ca. Ca tử vong do virus A H1N1 đầu tiên được thông báo vào ngày 23 tháng 7 năm 2009 và cho đến nay đã có 78 ca tử vong được thông báo.