Sinh ra ở Ilhéus, Wagner bắt đầu chơi bóng ở các câu lạc bộ địa phương ở giải đấu bang Bahia, Goiás và São Paulo trước khi có sự nghiệp 11 năm ở Bosnia và Herzegovina. Anh rời khỏi Jaboticabal Atlético cho HSK Posusje vào tháng 7 năm 2003.[3] Tiền vệ đã có trugn bình hơn 10 bàn một mùa giải khi thi đấu cho Široki Brijeg.[4]

Anh trai của Wagner, Ricardo Santos Lago, cũng là một cầu thủ bóng đá quốc gia Bosnia và Herzegovina.[4]