Quyền đồng tính nữ, đồng tính nam, song tính và chuyển giới ở El Salvador có thể phải đối mặt với những thách thức pháp lý mà những người không - LGBT không gặp phải. Cả hai hoạt động tình dục đồng giới nam và nữ đều hợp pháp trong El Salvador, nhưng các cặp vợ chồng và hộ gia đình đồng giới do các cặp đồng giới đứng đầu không đủ điều kiện để có sự bảo vệ pháp lý giống nhau đối với các cặp vợ chồng khác giới.Người LGBT ở El Salvador phải đối mặt với tỷ lệ bạo lực và giết người cao. Khoảng 500 tội ác căm thù đối với người LGBT đã được báo cáo từ năm 1998 đến 2015. Để đáp lại, Hội đồng Lập pháp đã thông qua một đạo luật quy định hình phạt tù cho những tội ác thù hận đó. Nhưng sự phân biệt đối xử vẫn còn phổ biến. Năm 2018, Chính phủ đã phê duyệt chính sách mới, cho phép người LGBT nộp đơn khiếu nại pháp lý khi bị phân biệt đối xử.