Marguerite xứ Bourbon (tiếng Pháp: Marguerite de Bourbon; k. 1211 – 12 tháng 4 năm 1256) là vương hậu của Navarra và Nữ bá tước phu nhân xứ Champagne từ năm 1232 đến năm 1253 với tư cách là người vợ thứ ba của vua Theobald I của Navarre. Sau khi chồng qua đời, bà cai trị cả vương quốc và lãnh địa bá tước với tư cách nhiếp chính trong ba năm dưới danh nghĩa con trai của họ, Theobald II của Navarre.