Bệnh lý giải phẫu (Commonwealth) hoặc Giải phẫu bệnh học (Hoa Kỳ) là một chuyên khoa y tế liên quan đến chẩn đoán bệnh dựa trên kiểm tra vĩ mô, kính hiển vi, sinh hóa, miễn dịch và phân tử của các cơ quan và mô. Trong thế kỷ qua, bệnh lý phẫu thuật đã phát triển vượt bậc: từ kiểm tra lịch sử toàn bộ cơ thể (khám nghiệm tử thi) đến thực hành hiện đại hơn, tập trung vào chẩn đoán và tiên lượng bệnh ung thư để hướng dẫn ra quyết định điều trị trong ung thư. Người sáng lập hiện đại của chuyên khoa này là nhà khoa học người Ý, Jacan Battista Morgagni từ Forlì.Bệnh lý giải phẫu là một trong hai nhánh của bệnh lý, nhánh còn lại là bệnh lý lâm sàng, chẩn đoán bệnh thông qua phân tích phòng thí nghiệm dịch cơ thể và/hoặc mô. Thông thường, các nhà giải phẫu bệnh thực hành cả giải phẫu bệnh lý và lâm sàng, một sự kết hợp được gọi là bệnh lý chung. Các nhánh tương tự tồn tại trong bệnh lý thú y.