Giải bóng đá hạng Nhì Quốc gia 2003 là giải thi đấu bóng đá cấp câu lạc bộ cao thứ 3 trong hệ thống các giải bóng đá Việt Nam (sau Giải Vô địch Quốc gia chuyên nghiệp và Giải bóng đá hạng Nhất Quốc gia). Có 16 đội hạng nhì gồm: Bến Tre, Bình Thuận, Đồng Nai, Đội trẻ Gạch Đồng Tâm- Long An, Hà Tĩnh, Khánh Hoà, K.S Khải Hoàn, Kon Tum, Quảng Ninh, Quảng Nam, QK3, QK4, Sinhanco TPHCM, Thanh niên Hà Nội, Trà Vinh, Vạn Chinh.[1][2] [3]