Mùa thứ hai của Bài hát hay nhất được ghi hình trước và phát sóng từ ngày 4 tháng 3 năm 2018, vào lúc 21:15 mỗi chủ nhật hàng tuần trên VTV3 riêng đêm Liveshow Chung kết được truyền hình trực tiếp vào lúc 21:10 ngày 13 tháng 5 năm 2018 trên VTV3.[1] Chương trình được dẫn bởi MC Phí Nguyễn Thùy Linh. Nhạc sĩ Hồ Hoài Anh thay thế Nguyễn Hải Phong ngồi ghế giám khảo cũng với ba nhạc sĩ của mùa trước là Đức Trí, Giáng Son và Lê Minh Sơn.[2][3]Có một số thay đổi trong luật chơi so với mùa thi trước. Ở vòng "Thu âm", các giám khảo không bị che khi xem các màn trình diễn, và mỗi giám khảo sẽ chọn cho đội của mình bảy thí sinh (thay vì là tám) để thi đấu ở các vòng "Sáng tác", "Tranh đấu" và "Liveshow".[4]